PEAKS Studio 13.1

 🧪 肽白质鉴定
使用 FDR 对照改进了 DeepNovo 测序。
通过深度学习提升从头辅助数据库搜索，以最大限度地提高肽鉴定效率。
DIA 工作流程 （Spectral Library Search + directDB + de novo）。
加快 CPU 和 GPU 资源的分析时间。
增强了直接数据库搜索的灵敏度和准确性。
增强的基于深度学习的技术，用于预测谱图、保留时间和碰撞截面值。
混合 DIA 和靶向蛋白质组学解决方案。
翻译后修饰 （PTM） 搜索具有 500+ 内置和/或定制修饰，并且能够使用特征离子和中性丢失来提高修饰肽的可信度。
序列变异和突变搜索。
基于 DeepNovo 的免疫肽组工作流程：集成的经典和非经典数据库搜索、同源搜索和 DeepNovo，用于通过 FDR 控制改进 HLA 肽组学。
DIA Peptidome 工作流程。
 卓越的免标记和标记定量
无标签和基于标签：TMT（MS2、MS3）/ iTRAQ、SILAC、18D 标签、ICAT、用户定义。
定量结果可以使用热图、相关图和提取离子色谱图 （XIC） 进行可视化。
 易于使用的界面和卓越的结果可视化
详细且易于使用的图形用户界面 （GUI） 用于查看、筛选和验证结果。
光谱库查看器，用于在使用前评估质量并验证库。
统计计算以可视化方式呈现，以评估原始数据和/或结果的质量。
LC-MS/MS 热图可全面显示肽特征、MS/MS 谱图采集以及相对于质量过电荷 （m/z）、保留时间 （RT）、补偿电压 （CV）、离子淌度 （1/k0） 和信号强度的鉴定位置。
 供应商中立，并经过微调以利用最新的 MS 技术
PEAKS IMS 附加模块：支持离子淌度质谱蛋白质组学（timsTOF Pro、FAIMS）。
针对每种仪器和碎裂类型微调的算法，以确保最佳的准确性和灵敏度。
全面支持 DDA 和 DIA，用于鉴定和定量分析。 

PEAKS 12.5DIA

LFQ支持high precision和high accuracy两种模式

DDA DeepNovo 

Peptidome workflow将蛋白质组学和基因组学结合

支持具有基因位点的非标准参考序列库

使用 GraphNovo 算法和 FDR 质控提升DeepNovo 多肽测序流程

基于特征峰的LFQ

SPIDER新增可信修饰位点判定

支持DeepNovo DIA 多肽组工作流程

PEAKS Studio新增靶向蛋白质组学数据分析功能（PRM、HybridDIA）

  改进的DIA性能

我们增强版的DIA将加速您的发现，确保准确且全面的结果，提供复杂的生物学洞见！


增强型PRM分析
我们精炼的PRM/MRM人力资源工作流程为所有主要厂商提供高选择性、高灵敏度和高通量的无标记和标记定量，并保证可靠地确认靶向肽。轻松调整保留时间以实现准确的信号剖面对齐，微调片段离子选择以实现最佳提取，并在提交更新前预览每一次变更。

增强型过渡列表生成器工具
用户现在可以从多种来源生成PRM靶向肽定量的质量列表——包括PEAKS定量和鉴定结果、PEAKS光谱库以及外部FASTA。PEAKS Studio 13.1 允许将过渡列表导出为与厂商仪器直接兼容的格式。

增强型DIA肽组
DIA DeepNovo 肽组已在准确性和速度上均进行了优化，现在支持用户自定义的“候选名单”，形式包括光谱库或包含样品中预期肽段的肽表。DIA工作流程中还新增了一个蛋白质标签页，以提升数据解读。

通过序列变异和新肽解锁暗蛋白质组通过人类和小鼠数据库搜索人类三消化酶，数据库中识别出人类肽，而小鼠肽则通过新的DIA蜘蛛作为突变识别：



全结果透明新功能标签页概述了每个DIA识别步骤的所有特征关联，允许用户调查、验证和确认结果。