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可视化量子化学计算程序 Chemcraft 1.8 Build 562 破解版

(认准闪电软件园)
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  • 更新时间:2019-10-21
  • 软件大小:未知
  • 界面语言:简体中文
  • 授权方式:共享软件
  • 运行环境:Win7/win8/win10
  • 官方网站:闪电软件园

软件标签:Chemcraft Chemcraft破解版 
Chemcraft破解版是功能强大的是用于量子化学计算程序,软件支持通过原子坐标绘制分子的3维图像,并可以检查或修改分子中的任何几何参数(距离,角度)。提供构建和修改分子几何形状的工具,您可以使用标准分子片段,并拖动图像中的原子和片段进行相关操作,非常方便,这款强大的图形化程序使用将为用户带来方便的可视化计算操作,并快速得到准确的结果,为您的工作带来更大的便捷,软件支持处理各种计算类型,支持使用以文本格式导入/导出原子坐标。虽然说Chemcraft本身不执行计算,但是可以大大方便使用广泛的量子化学软件包。本次带来最新破解版下载,含注册码,有需要的朋友不要错过了!

安装破解教程

1、在本站下载并解压,双击Chemcraft.exe运行,点击Enter registration key按钮
2、下列注册码任选一个输入即可,点击ok
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功能特色

1、通过原子坐标绘制分子的3维图像,并可以检查或修改分子中的任何几何参数(距离,角度); 
2、游戏,高斯,NWChem,ADF,Molpro,Dalton,Jaguar,Orca,QChem输出文件的可视化:文件中各个几何的表示(优化结构,每个优化步骤的几何等),振动模式动画,图形表示梯度(作用在核上),等值面或有色平面形式的分子轨道的可视化,振动或电子(例如TDDFT)光谱的可视化,显示SCF收敛图的可能性以及其他一些特征; 
3、用于构建分子和修改分子几何形状的不同工具:使用标准分子片段,“拖动”分子图像中的原子或片段,设置对称点组的实用程序以及其他可能性; 
4、以可定制的显示模式制作分子的出版物就绪图像,其中包含所需的名称(标签,线条等); 
5、用于准备输入文件的一些附加实用程序:构造Z矩阵,自动生成具有非标准基集的输入文件,将从输出文件读取的MO转换为输入文件的格式。 
6、该程序结合了先进的图形用户界面和为实际使用而设计的有益功能。Chemcraft基于将文件划分为单独的元素并将其显示在分层的多级列表中,从而提供了非常详细的输出文件的结构化可视化;此功能使您可以轻松分析复杂的文件,例如扫描作业,IRC作业或多作业计算。Chemcraft的图形引擎不需要任何硬件加速。
7、Chemcraft是一种商业软件。Windows版本的价格目前对于学术用户为160美元,对于其他用户为300美元。也可以下载Chemcraft for Windows的免费软件版本,它具有一些限制和导航屏幕。

使用说明

1、Chemcraft基础  
Chemcraft包含一组图形工具,可帮助进行量子化学计算。它提供了方便的实用程序,可帮助准备新作业以进行计算和分析计算结果。该程序的主要功能是可视化量子化学软件包产生的输出文件。支持的主要软件包是Games(美国版和PCGames)和Gaussian94-09。  
2、Chemcraft游戏用户  
Chemcraft提供了Games-US输出文件的非常详细的可视化。文件中的以下数据可以图形方式显示:  
-原子坐标(如果文件中存在相应的表,则对应于全部或对称唯一原子);  
-如果在文件中提供了键顺序分析,则文件中的键会显示在图像上(否则,键是通过距离算法计算的);  
-能量梯度可以以指针的形式显示(图2);  
-不同的原子特性可以显示为原子上的标记:穆里肯数和电荷,自旋密度,化合价;  
-债券定单(作为债券上的标签);  
-分子轨道可视化为等值面或彩色平面;  
-振动模式可以设置动画或以指针(位移矢量)的形式显示;  
-偶极矩可以可视化为指针;  
-MO能量可以以图的形式显示。  
该程序提供输出文件的结构化表示。读取的文件分为单独的元素,例如单独的几何形状或振动模式。对于每个元素,将从文件中提取所有可用数据:原子坐标,能量梯度等。所有元素都以层次结构列表的形式显示(见图1)。单击列表的元素会自动在图像上显示各个几何形状或模式,并允许可视化不同的属性。该界面可提供可靠的计算数据可视化,包括非标准类型的计算,不完整的计算等。它还可以可视化具有多个计算作业的复杂文件。对于能量扫描或IRC计算,所有几何形状均按扫描/IRC步骤分为几组。

能量梯度可视化示例。
  Chemcraft从GAMESS-US输出文件中提取分子轨道系数以及基本信息,并以等密度面或以密度值着色的表面(平面,球体)的形式绘制分子轨道(见图3)。Chemcraft提供了一些执行轨道操作的可能性(例如,将一个轨道与另一个轨道相乘)。建立轨道的公式取自随GAMESS-US发行的PLTORB程序的源代码。具有密度值的多维数据集的计算得到了很好的优化。请注意,如果文件中有多个分子轨道系数表,则Chemcraft会提取它们中的每一个并允许对其进行渲染(例如,在MCSCF计算中,可以显示标准轨道或自然轨道)。除了可视化轨道,

分子轨道可视化的示例。
  Chemcraft支持一个界面,用于快速创建带有非标准基础集的GAMESS-US输入文件的各个部分(图4)。基集是从它们的描述中提取的,可以从PNNL的网页(http://www.emsl.pnl.gov/forms/basisform.html)中获得。它们还可以由用户指定的其他高斯来补充。
3、适用于高斯用户的Chemcraft
  我们建议在高斯输入文件中键入#P GFINPUT POP(FULL,NBO),以便通过Chemcraft可视化高斯输出。#P选项启用扩展的打印输出;GFINPUT选项启用基集信息的打印输出(基集中基元的描述),而POP(FULL)启用所有分子轨道系数的打印输出(也可以使用POP(REGULAR))。后两个关键字允许Chemcraft可视化分子轨道。POP(NBO)可以打印出“自然键轨道”分析,其中可以计算分子中的键。所有这些关键字都是可取的,但不是必需的。对于GAMESS文件,可以看到文件中的不同数据:作用在核上的力(能量梯度),原子电荷,自旋密度和其他原子特性,NBO键的特性(占有率,能量),正常模式,分子轨道(可以显示笛卡尔(6d等)或内部(5d)函数),MO能量。从文件中读取标准或输入/ Z矩阵方向的坐标,并将其显示在图像上(这对于正确可视化作用在核上的力是必需的,因为它们通常以与其他属性不同的方向打印)。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。等)或内部(5d)功能可以可视化),MO能量。从文件中读取标准或输入/ Z矩阵方向的坐标,并将其显示在图像上(这对于正确可视化作用在核上的力是必需的,因为它们通常以与其他属性不同的方向打印)。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。等)或内部(5d)功能可以可视化),MO能量。从文件中读取标准或输入/ Z矩阵方向的坐标,并将其显示在图像上(这对于正确可视化作用在核上的力是必需的,因为它们通常以与其他属性不同的方向打印)。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。从文件中读取标准或输入/ Z矩阵方向的坐标,并将其显示在图像上(这对于正确可视化作用在核上的力是必需的,因为它们通常以与其他属性不同的方向打印)。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。从文件中读取标准或输入/ Z矩阵方向的坐标,并将其显示在图像上(这对于正确可视化作用在核上的力是必需的,因为它们通常以与其他属性不同的方向打印)。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。对于能量表面扫描和IRC作业,所有几何形状均按扫描步骤分组。对于每个单独的几何形状或振动模式,概述了最基本的数据并将其显示为“抽象”(SCF能量,收敛准则等)。Chemcraft读取多步高斯作业,然后将其显示为几个扩展节点的列表,每个节点代表文件中的单个作业。
  除了高斯输出文件外,Chemcraft还可以读取格式化的检查点文件(.fch),从文件中提取分子结构和轨道。为了可视化分子轨道和其他特性,还可以读取高斯立方体文件。
  Chemcraft使用NMR计算(GIAO,CSGT)从高斯日志文件中读取各向同性屏蔽值。提供了一种简单的实用程序,用于将其重新计算为化学位移并在指定的原子组内求平均值。
4、适用于ADF用户的Chemcraft
Chemcraft读取ADF输出文件,ASCII TAPE21文件和ASCII TAPE41文件。目前,ADF输出文件的可视化不如GAMESS或高斯文件的可视化:提供能量提取,偶极矩和某些原子特性的可视化,但没有分子轨道的可视化等。
5、使用其他格式
  除了Games-US,Gaussian和ADF文件之外,Chemcraft还可以读取NWChem,Jaguar,Orca,Dalton,GAMESS-UK,Turbomole,Molpro和QChem输出文件,HyperChem文件,MSI或PDB格式的文件(不全面支持这些格式)以及MolDraw和Priroda程序格式,NBO格式(.31-.40文件),Molden文件,MFJ,SDF和Tinker文件,Crystal,VASP和Shellx文件,晶体学CIF文件以及具有原子笛卡尔坐标的简单文本文件。Chemcraft提供了一个界面,可通过剪贴板以文本格式导入/导出原子坐标,这有助于使用任何类型的计算中的数据。将原子坐标导出到剪贴板对于快速创建输入文件也很有用。  
  Chemcraft包含一个实用程序,可用于将晶体学测量中使用的分数坐标转换为笛卡尔坐标,以及反之,使用晶胞参数(a,b,c等)。
6、构造分子  
Chemcraft支持一套用于构建分子结构的工具,可用于准备用于计算或其他目的的初步猜测:  
-从标准分子片段(自由基等)构建分子。提供了用自定义片段补充片段集并通过剪贴板复制/粘贴单个片段的可能性;  
-修改分子中的任何几何参数(距离,角度,二面角)。所述修饰可以伴随一个原子,两个原子或所选原子组的置换;  
-使用鼠标“拖动”原子或片段在分子图像上或旋转片段的可能性(图5);  
-用于应用任意几何参数集的迭代算法(图6);  
-易于使用的工具,可将点基应用于分子(图8)。

拖动”原子或沿键旋转片段的示例。
  当“拖动”原子或执行其他结构修改时,可以在图像上控制任何几何参数(参见图5)。Chemcraft的界面允许人们轻松更改任何原子的类型或插入/除去键。
  Chemcraft提供了一种用于快速获取z矩阵的实用程序。通过单击分子中的原子并指定一些其他信息来构建z矩阵(图7)。在使用该实用程序之前,应首先获取笛卡尔坐标中的分子结构。所有上述用于构建分子的工具均可用于此目的。

应用一组指定的几何参数。

Z矩阵的可视化构造。       
Chemcraft可以调整分子中的原子坐标以应用指定的对称性(图8)。此实用程序在您的研究中非常有用,因为对称分子的计算速度比非对称分子快。

应用对称点组
7、合并分子结构
  Chemcraft支持一套用于构建分子结构的工具,可用于准备用于计算或其他目的的初步猜测:

合并多个结构  
在使用此实用程序之前,应选择几个原子以使其彼此最大距离放置(在图9中,这些原子标记为白色)。  
除此功能外,Chemcraft还可以计算两个分子之间的均方根差。
8、分子渲染的可能性  
Chemcraft可以生成分子的高质量32位图片。它被设计为用于创建发布就绪图像的程序,不需要任何其他修改。可以在原子/键和其他对象(例如标签和线条)上轻松添加图片标题来补充图片。Chemcraft包含一组标准显示方案。每个方案代表一组定义分子外观的参数:照明参数,单个原子和键的颜色和大小等。图10展示了该集合的四个方案。Chemcraft允许用户更改单个方案的参数或将自己的方案添加到集合中。  
Chemcraft的图形引擎不需要任何图形加速或其他图形库。它经过了优化,即使在过时的计算机上也可以提供很高的渲染速度。

用不同的显示方案和不同的标签样式渲染分子的示例。
9、创建动画
Windows版本的Chemcraft可以以多个位图文件或gif动画文件的形式保存分子的动画图片。提供以下标准动画类型:分子旋转动画,振动频率和PES扫描动画。以下动画是使用Chemcraft创建的:

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